分子动力学

刚接触分子模拟时，你会听到一大堆名字：LJ、EAM、CHARMM、AMBER、OPLS、ReaxFF、MARTINI、DeepMD……每个名字都代表一种力场，也代表一种理解原子世界的方式。本文想从头到尾捋一捋：这些力场是怎么来的、它们各自擅长什么、以及什么时候该用什么。

在计算模拟研究中，模型的选择直接决定了结果的可靠性和研究的价值。一位研究生曾在暑假期间烧掉了8000多元的机时费，最终数据却完全无法使用，原因正是初始模型选择不当。本文将剖析计算模拟中常见的五种"坑人"模型，帮助研究者在实际工作中避开这些代价高昂的陷阱。